| 04.09.2016 | 12:00 | QF1 |  NK CLIMAX Vsetín | VSET |  SK Šacung Benešov 1947 | SACU | 4:0 | |
| 04.09.2016 | 13:00 | QF1 |  Slovan Chabařovice | CHAB |  SK Bělá | BELA | 4:0 | |
| 04.09.2016 | 13:00 | QF1 |  TJ Sokol Zbečník | ZBEC |  TJ SLAVOJ Český Brod | CBRO | 4:1 | |
| 04.09.2016 | 14:30 | QF1 |  TJ DYNAMO České Budějovice | CBUD |  MNK SILNICE GROUP Modřice | MODR | 0:4 | |
| 11.09.2016 | 14:00 | QF2 | SK Šacung Benešov 1947 | SACU | NK CLIMAX Vsetín | VSET | 0:4 | |
| 11.09.2016 | 14:30 | QF2 | MNK SILNICE GROUP Modřice | MODR | TJ DYNAMO České Budějovice | CBUD | 4:0 | |
| 11.09.2016 | 15:00 | QF2 | SK Bělá | BELA | Slovan Chabařovice | CHAB | 3:4 | |
| 11.09.2016 | 16:00 | QF2 | TJ SLAVOJ Český Brod | CBRO | TJ Sokol Zbečník | ZBEC | 4:0 | |
| 18.09.2016 | 13:00 | QF3 | TJ Sokol Zbečník | ZBEC | TJ SLAVOJ Český Brod | CBRO | 4:0 | |
| 25.09.2016 | 12:00 | SF2/1 | NK CLIMAX Vsetín | VSET | MNK SILNICE GROUP Modřice | MODR | 3:4 | |
| 25.09.2016 | 13:00 | SF1/1 | Slovan Chabařovice | CHAB | TJ Sokol Zbečník | ZBEC | 1:4 | |
| 28.09.2016 | 10:00 | SF2/2 | MNK SILNICE GROUP Modřice | MODR | NK CLIMAX Vsetín | VSET | 4:3 | |
| 02.10.2016 | 13:00 | SF1/2 | TJ Sokol Zbečník | ZBEC | Slovan Chabařovice | CHAB | 4:1 | |
| 09.10.2016 | 10:00 | 3M | Slovan Chabařovice | CHAB | NK CLIMAX Vsetín | VSET | 4:0 | |
| 09.10.2016 | 13:00 | F1 | TJ Sokol Zbečník | ZBEC | MNK SILNICE GROUP Modřice | MODR | 2:4 | |
| 16.10.2016 | 12:00 | F2 | MNK SILNICE GROUP Modřice | MODR | TJ Sokol Zbečník | ZBEC | 4:1 | |